Ocak 2006'da, Uluslararası Güvenlik Yardım Gücü (ISAF), İslamcı paramiliter Taliban'a karşı mücadelede ABD ve Birleşik Krallık ordusuna yardım etmek üzere Afganistan'a konuşlandırıldı. ABD hükümeti, Taliban'ı El Kaide lideri Usame bin Ladin'e yataklık etmekle suçladı ve iadesini talep etti. Taliban liderliği, ABD'nin Usame'nin 9/11/2001 saldırılarında suçlu olduğuna dair kanıt sağlamadığını söyleyerek bu talebe uymayı reddetti.
2001 yılının sonunda, Taliban'ın askeri yapısı fiilen yok edildi ve destekçilerinin direnişi bir gerilla hareketi şeklini aldı. Batılı ülkeler, demokrasinin ve Afganistan'ın sosyal yapısının geliştirilmesine büyük yatırımlar yaptılar. 2004 yılında, ülkenin ilk cumhurbaşkanlığı seçimlerini Batı'ya yeterince sadık bir politikacı olan Hamid Karzai kazandı. Ancak Taliban yanlılarının direnişi bastırılamadı. Gerillalar, ISAF'ın ezici askeri üstünlüğüne rağmen şiddetle savaştı.
Fransa, ittifakın diğer üyeleri gibi, ekipman ve insan gücünde kayıplara uğradı. Afganistan'daki 10 yıllık savaş sırasında 83 asker öldü ve birkaç kat daha fazla yaralandı. Fransa'yı askeri operasyona dahil etme kararı halk arasında pek popüler değildi ve Fransız askerleri arasındaki kayıp raporları hükümete karşı hoşnutsuzluğu artırdı.
20 Ocak 2012'de Kapisa vilayetinde Afgan ordusu üniformalı bir adam 4'ü kurşuna dizerek 16 Fransız askerini yaraladı. Bundan sonra Nicolas Sarkozy (2007'den 2012'ye kadar Fransa Cumhurbaşkanı), Afgan hükümetinin Fransız birliklerinin güvenliğini garanti edemediği için Fransa'nın o ülkedeki askeri varlığını askıya aldığını söyledi. Sarkozy, 2014 başlarında Afganistan'dan asker çekme sözü verdi.
2012 yılında François Hollande, Afganistan'dan çekilmek için yeni bir plan açıklayan Fransa Cumhurbaşkanı seçildi. 2012 yılı sonuna kadar 2.000 asker geri çekilecek, 1.400'ü eğitmen olarak ve sosyal tesisleri korumak için kalacak. Cumhurbaşkanı kararını, terör tehlikesinin azaldığı, demokrasinin güçlendiği ve ülkenin bağımsız olarak gelişmesi gerektiği gerçeğiyle açıkladı. Cumhurbaşkanı, Fransa'nın Afganistan'ı desteklemeye devam edeceğine söz verdi, ancak farklı bir biçimde.
